Una nueva jungla
Lo primero y más llamativo de Crysis 2 es un elemento que ya se conoce desde el anuncio del título: la ambientación ha cambiado de una jungla natural a una jungla urbana. Quienes crean que el cambio de entornos supone una modificación drástica del modo de comprender los entornos y lograr posibilidades tácticas, están muy equivocados, dado que la ciudad a nuestros pies se convierte en una jungla de hormigón y cristal tan compleja o más que las junglas de las islas Lingshan. Sin embargo, todo transmite otro espíritu diferente, la forma de comprender el entorno varía, las amenazas no son las mismas, y ni tan siquiera nosotros tendremos nada que ver directamente con el equipo que se enfrentó a la amenaza alienígena en el primer Crysis.

Han pasado tres años desde el capítulo original, por lo que la acción se sitúa en el 2023. La ciudad de Nueva York es apenas un caparazón vacío tras la evacuación de la población debido a una infestación alienígena, una urbe en decadencia que simboliza el primer paso de lo que podría ser una invasión a gran escala que acabase con toda la humanidad. Una unidad especial de marines acude en misión de apoyo a la ciudad, pero un ataque alienígena destruye del vehículo de transporte y provoca una masacre. El protagonista, que posee el irónico nombre de Alcatraz, logra salvarse con algo de ayuda y, sin saber muy bien cómo, acabará recibiendo el nanotraje de manos de Prophet (un antiguo conocido del primer juego). Su pesadilla comienza en ese momento, ya que se ve involucrado en medio de varias guerras cruzadas.